На жаль, стіни цього святого місця не раз були понівечені під час Другої світової війни. І йдеться не про фізичне осквернення, а про духовне. Так, в 1939 р. саме там радянська влада розмістила НКВС. А після цього німці розмістили там Гестапо. Саме там розстрілювали італійських військовополонених. Як тільки закінчилася війна туди знову повернулося НКВС і розташовувалося там до 1952 р. На згадку про ці непрості часи зберегли останки репресованих. Починаючи з 1996 р. громада церкви Святого Климента боролася і робила все, щоб в костелі знову почали проводити богослужіння. І 29 вересня 2011 р. храм передали у власність громади.