Реставраційні та ремонтні роботи проводились в костелі Різдва Іоанна Хрестителя в 1901-1904, 1913-1919 і в 1933 роках. Після Другої світової війни храм залишався діючим. В кінці 70-х років минулого століття з костелу забрали головний вівтар, який був зроблений в неоготичному стилі і прикрашений фігурами Божої Матері і Іоанна Хрестителя, створеними майстром Долабелле. У свій час його заміняв вівтар зі Старого Самбора. Останнім часом його замінив вівтар з костелу в Мильчиці, який перетворений в церкву. Костел Різдва Іоанна Хрестителя в Мостиськах внесений до списку пам’яток архітектури, що охороняються державою.