Залізнична станція Попільня виникла в 1870 році внаслідок створення лінії Київ – Фастів – Козятин. У 1964 році двоколійну лінію, на якій розташована станція, підключено до електрики, що забезпечило рух електропоїздів. Раніше станція обслуговувала здебільшого цукрові заводи, розташовані поблизу. Нині на лінії налагоджено пожвавлений рух електропоїздів сполучення Київ – Козятин, а також швидкісних електропоїздів обласного сполучення.