Станцію побудували в 1916 році, активна експлуатація почалася з 1928 року. До початку Великої Вітчизняної війни вокзал був під підпорядкуванням Білоруської залізниці. Після війни, в радянські часи, Горностаївку щодня перетинало 8 пар тепловозів в напрямку білоруського обласного центру Гомеля, на станції виконувалися великі обсяги вантажних робіт. З початку незалежності України вантажний і пасажирський обіг значно зменшився (кілька оброблених вантажних вагонів, 30-50 пасажирів на день). До того ж після розпаду Радянського Союзу вокзал виконує функцію прикордонної станції України. Тут здійснюється митний контроль над пасажирами транзитних рейсів з боку Мінська і Санкт-Петербурга. Цікавим є той факт, що Горностаївка знаходиться в Добрянці, але вокзал не названий на честь селища. Так було вирішено у зв’язку з законом, який передбачає скасування однакових найменувань станцій (адже до цього в Пермському краї вже існувала станція Добрянка). Селище Горностаївка знаходиться в п’яти кілометрах від станції.