Станція була відкрита в 1960 році. Її назва пов’язана з розташованої поруч горою Синя (гранітний виступ в Приазовської степу). Татаро-монгольські племена назвали її "Токмак", а запорізькі козаки - "Токмак-могила". Місцеві жителі називають гору Синьою. На сьогоднішній день через станцію Синя гора курсує два поїзди далекого прямування і чотири приміського сполучення. Звідси без пересадок можна доїхати до Запоріжжя, Верхнього Токмака, Бердянська, Полог, Ростущого та Кирилівки. Всі поїзди мають щоденний графік руху.