Перша церква, яка поклала початок монастирському комплексу, розташовувалася на території нинішнього скиту. Подейкують, що саме тут відбулося явлення ікони Святого Миколая Чудотворця. Переживши татарську навалу та безліч інших історичних подій, монастир в XVII столітті знову почав функціонувати, але вже як чоловічий. Будівля була спалена під час Батуринської трагедії 1708 року. Згодом монастир відродили. Однак, з 1922 року, з приходом радянської влади розпочався наступний період небуття. У 1999 році монастир отримав друге життя, а в стіни храму повернули чудотворну ікону святителя Миколая. Нині монастир діє, споруда є доглянутою, перебуває в хорошому стані.