Храм Миколая отримав сьогоднішні обриси в середині XVII століття. Точна дата кінця будівельних робіт не відома, але місцеві краєзнавці стверджують, що храм зводився в період з 1650 по 1670 роки. Раніше на цьому ж місці стояла однойменна церква, побудована з дерева. Історичні літописи пишуть, що кам’яну споруду зводили козаки з Ніжинського полку, кошти на будівництво виділили брати Василь та Іван Золотаренко. До сьогоднішніх днів зберігся оригінальний текст документа, в якому ніжинська міщанка в своєму заповіті вказала передати третю частину її заощаджень для будівництва храму. Собор Святого Миколая віддзеркалює риси раннього українського бароко.