З церквою Іоанна Богослова у Головківці пов’язано кілька легенд. Одна з них говорить про те, що під час руйнування церкви більшовиками було заховано дзвони. Священик намагався дізнатися, де ж саме, щоб знайти їх і зберегти до кращого часу. Людина, котра вкрала дзвін, відмовилася виказати його місце, та за якийсь час і ця людина, і її двоє родичів повісилися. Місцеві говорили, що Господь не пробачив наруги над святинями. Після радянського періоду церква була відремонтована. Рештки колон від старого приміщення церкви видно досі. Нині в церкві проводять служби; поряд з нею є колодязь. Місцеві мешканці вірять, що вода в ньому чудодійна і лікує низку хвороб. Багато людей, котрі побували в храмі, відзначають, що там вони позбуваються занепокоєння, тривоги, а їхню душу опановують умиротворення і спокій.