У далекому 1645 році був заснований перший жіночий монастир у Немирові, який був зруйнований татарами, проіснувавши трохи менше півстоліття. Лише у другій половині XVIII століття у місті було засновано православний чоловічий монастир, який трохи пізніше був перетворений на жіночий. Будівництво монастиря відбулося завдяки київському графу Вінценту Потоцькому. У подальші два століття монастир піддавався пожежам, був реконструйований, добудовано кам’яний храм і дві дзвіниці. У 1929 році монастир був повністю закритий, і лише в 1992 році у Свято-Троїцькому храмі була відслужена перша за довгі роки затишшя святкова літургія. А в 1996 році було прийнято рішення і про відродження немирівського монастиря, який нині має статус ставропігійного. Це означає, що монастир підпорядковується безпосередньо Патріархові.